Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMAN2Q12907 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMAN2Q12907 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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