Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXO1Q12778 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXO1Q12778 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXO1Q12778 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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