Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP160Q12769 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms