Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms