Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
LRP1Q07954 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms