Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDE4BQ07343 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms