Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GABPB1Q06547 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GABPB1Q06547 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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GABPB1Q06547 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABPB1Q06547 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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