Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A2Q05940 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms