Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPCQ03188 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms