Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DSC2Q02487 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms