Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E2F1Q01094 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms