Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TUBA4AP68366 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms