Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HERVK_113P61574 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms