Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMSP52788 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMSP52788 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMSP52788 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SMSP52788 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SMSP52788 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SMSP52788 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SMSP52788 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SMSP52788 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SMSP52788 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMSP52788 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMSP52788 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMSP52788 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMSP52788 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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