Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms