Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms