Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERFP50548 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ERFP50548 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ERFP50548 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms