Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIA4P48058 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms