Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMPOP42166 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMPOP42166 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms