Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPARGP37231 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PPARGP37231 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms