Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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CASQ1P31415 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CASQ1P31415 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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CASQ1P31415 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASQ1P31415 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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