Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASP1P29466 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms