Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DUSP1P28562 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DUSP1P28562 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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