Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSFA2P28290 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SSFA2P28290 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms