Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
IL3RAP26951 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms