Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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CTSSP25774 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTSSP25774 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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