Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCP2P22307 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCP2P22307 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCP2P22307 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCP2P22307 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SCP2P22307 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms