Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRHP20396 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRHP20396 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRHP20396 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRHP20396 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRHP20396 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRHP20396 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRHP20396 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRHP20396 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms