Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIG1P18858 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIG1P18858 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms