Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXB9P17482 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HOXB9P17482 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HOXB9P17482 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HOXB9P17482 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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