Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPD1P17405 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms