Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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