Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC130P13994 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC130P13994 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms