Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT10P13645 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT10P13645 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT10P13645 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT10P13645 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRT10P13645 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRT10P13645 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KRT10P13645 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms