Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BCKDHAP12694 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms