Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPREB1P12018 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
VPREB1P12018 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms