Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNB1P11230 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms