Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PYGBP11216 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PYGBP11216 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC010203.1-201ENST00000548404 928 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PYGBP11216 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms