Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMEM225BP0DP42 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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