Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC192P0DO97 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms