Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PGA3P0DJD8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms