Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSLP07711 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms