Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATG7O95352 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms