Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCATO75600 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCATO75600 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCATO75600 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms