Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CREB3O43889 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB3O43889 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB3O43889 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB3O43889 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB3O43889 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREB3O43889 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms