Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAB2O43741 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms