Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBDO15205 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBDO15205 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBDO15205 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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