Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRPO00591 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
GABRPO00591 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms