Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NFKBIEO00221 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms