Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms